東海大学農学部タンパク研リンク集 



Protein Chemistry
 
サイト
開示者
備考
PROWL
米国NIH
タンパク質化学・質量分析ツール集
簡単なPMF解析ツールもあります
DDBJ
国立遺伝学研究所 生命情報研究センターアミノ酸配列データベース検索および解析 (日本語版あり)
ExPASy
Swiss Institute of Bioinformatics (SIB)
タンパク質データに関する検索解析全般
タンパク質のペプチド断片分子量はProtein identification and characterizationのPeptideMass で計算できます.
EBIEuropean Bioinformatics Institute タンパク質データに関する検索解析全般. ペプチドホモロジーサーチ用のMPsrchはここのToolboxにあります.
Biology Workbench
National Center for Supercomputing Applications at the University of Illinois at Urbana-Champaign
タンパク質データに関する検索解析全般 ただし登録が必要
SCOP
MRC Laboratory of Molecular Biology and Centre for Protein Engineering
タンパク質立体構造分類および検索.プラグインソフトにより立体構造を自由に回転表示できる.(キーワードサーチが表示できない場合は海外のミラーサイトを利用して下さい)
ProDom
INRA, CNRS
タンパク質のドメイン構造データベース
InterPro  European Molecular Biology Laboratory  タンパク質中のドメイン構造や重要な部位の検索
Macromolecular 
Movements

Bioinformatics Lab
タンパク質の立体構造の動きをムービーで見れる
NCBI
NCBI
種々のタンパク質検索解析ツール
ペプチドの相同性検索はProtein BLAST がデフォルトで利用できます.
Predict Protein
European Molecular Biology Laboratoryドメイン,モチーフ検索から種々の構造予測までのツール集
CATH
Biomolecular Structure and Modelling Unit
タンパク質立体構造分類データベース
Mascot Search
Matrix Science PMF解析,シークエンスタグ解析その他のツールが利用できます



Data Search
サイト
開示者
備考
GenBank
NCBI
遺伝子データベース
タンパク質側から決定された配列情報は含まれない
DDBJ
国立遺伝学研究所 生命情報研究センター
遺伝子データベース
GenBank(米国),EMBL(ヨーロッパ)との共同運用.日本語版あり
UniProtKB
Swiss Institute of Bioinformatics 
アミノ酸配列データベース
関連情報が豊富でProDomなどのリンク検索ができる
PDB  Protein Data Bank  タンパク質の立体構造データベース
PIR
Protein Information Resource
アミノ酸配列データベース
最も情報量が多い.遺伝子配列はアミノ酸に翻訳してある
MEDLINE
U.S. National Library of Medicine (NLM)
文献情報データベース
キーワードによる文献検索ができる.
文献はアブストラクトまで表示可能.
そのほかEntrez databasesサービスとして,ジャーナル検索や遺伝子,タンパク質検索も可能.



Journal
雑誌名
発行
(電子論文閲覧) 科学技術情報発信・流通総合システム(科学技術振興事業団
Journal of Biochemistry
日本生化学会
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
日本農芸化学会
Protein Science the Protein Society
The Journal of Molecular Biology
Elsevier
The Journal of Biological Chemistry 
American Society for Biochemistry and Molecular Biology
BBA - Biochimica et Biophysica Acta
Elsevier Science
Proceeding of the National Academy 
 of Sciences
the National Academy of Sciences, U.S.A
FEBS Letters 
Federation of European Biochemical Societies
the European Journal of Biochemistry 
Federation of European Biochemical Societies
Archives of Biochemistry and Biophysics
Elsevier
Analytical Biochemistry
Elsevier
Nature
Nature Publishing Group 
Science
American Association for the Advancement of Science
Biochemical and Biophysical Research
  Communications
Elsevier
The Protein Journal
Springer
Biochemistry
American Chemical Society
The EMBO Journal
European Molecular Biology Organization



試薬消耗品類

ナカライテスク                            一般試薬類  オンラインカタログから入って下さい         
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SIGMA 一般試薬,特殊試薬 米国サイト(英語版)製品検索を使って下さい
関東化学 HPLC試薬,質量分析試薬 試薬カタログから入って下さい
GEヘルスケア 2D試薬.旧アマシャムファルマシア 製品カタログから入って下さい
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アズワン 一般消耗品,器具類 商品検索から入って下さい




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