東海大学農学部タンパク研リンク集 |
サイト |
開示者 |
備考 |
PROWL | 米国NIH | タンパク質化学・質量分析ツール集 簡単なPMF解析ツールもあります |
DDBJ | 国立遺伝学研究所 生命情報研究センター | アミノ酸配列データベース検索および解析 (日本語版あり) |
ExPASy |
Swiss Institute of Bioinformatics (SIB) |
タンパク質データに関する検索解析全般 タンパク質のペプチド断片分子量はProtein identification and characterizationのPeptideMass で計算できます. |
EBI | European Bioinformatics Institute | タンパク質データに関する検索解析全般. ペプチドホモロジーサーチ用のMPsrchはここのToolboxにあります. |
Biology Workbench |
National Center for Supercomputing Applications at the University of Illinois at Urbana-Champaign |
タンパク質データに関する検索解析全般 ただし登録が必要 |
SCOP |
MRC Laboratory of Molecular Biology and Centre for Protein Engineering | タンパク質立体構造分類および検索.プラグインソフトにより立体構造を自由に回転表示できる.(キーワードサーチが表示できない場合は海外のミラーサイトを利用して下さい) |
ProDom |
INRA, CNRS |
タンパク質のドメイン構造データベース |
InterPro | European Molecular Biology Laboratory | タンパク質中のドメイン構造や重要な部位の検索 |
Macromolecular Movements | Bioinformatics Lab | タンパク質の立体構造の動きをムービーで見れる |
NCBI |
NCBI | 種々のタンパク質検索解析ツール ペプチドの相同性検索はProtein BLAST がデフォルトで利用できます. |
Predict Protein | European Molecular Biology Laboratory | ドメイン,モチーフ検索から種々の構造予測までのツール集 |
CATH |
Biomolecular Structure and Modelling Unit |
タンパク質立体構造分類データベース |
Mascot Search |
Matrix Science | PMF解析,シークエンスタグ解析その他のツールが利用できます |
サイト | 開示者 |
備考 |
GenBank | NCBI |
遺伝子データベース タンパク質側から決定された配列情報は含まれない |
DDBJ |
国立遺伝学研究所 生命情報研究センター |
遺伝子データベース GenBank(米国),EMBL(ヨーロッパ)との共同運用.日本語版あり |
UniProtKB | Swiss Institute of Bioinformatics |
アミノ酸配列データベース 関連情報が豊富でProDomなどのリンク検索ができる |
PDB | Protein Data Bank | タンパク質の立体構造データベース |
PIR | Protein Information Resource |
アミノ酸配列データベース 最も情報量が多い.遺伝子配列はアミノ酸に翻訳してある |
MEDLINE |
U.S. National Library of Medicine (NLM) |
文献情報データベース キーワードによる文献検索ができる. 文献はアブストラクトまで表示可能. そのほかEntrez databasesサービスとして,ジャーナル検索や遺伝子,タンパク質検索も可能. |
ナカライテスク | 一般試薬類 オンラインカタログから入って下さい |
和光純薬工業 | 一般試薬類 試薬ドットコムに登録する必要があります |
SIGMA | 一般試薬,特殊試薬 米国サイト(英語版)製品検索を使って下さい |
関東化学 | HPLC試薬,質量分析試薬 試薬カタログから入って下さい |
GEヘルスケア | 2D試薬.旧アマシャムファルマシア 製品カタログから入って下さい |
ケニス | 一般消耗品,器具類 商品検索システムのゲストで入って下さい |
アズワン | 一般消耗品,器具類 商品検索から入って下さい |